Ban tổ chức trung ương: Các kỳ Đại hội Giới trẻ Thế giới đều do Hội đồng Giáo hoàng về Giáo dân của Giáo triều Rôma làm ban tổ chức trung ương, hoạt động chỉ đạo. Tại thời điểm năm 2011, Hội đồng này do hồng yStanisław Ryłko (người Ba Lan) làm chủ tịch, thư ký là giám mục Josef Clemens (người Đức).
Ban tổ chức địa phương: là Tổng giáo phận Madrid đăng cai, chủ tịch là hồng y Antonio Maria Rouco Varela (tổng giám mục Madrid), và tổng điều phối là giám mục Augusto Cesar Franco Martinez (giám mục phụ tá Madrid). Ban tổ chức địa phương chia làm nhiều tiểu ban nhỏ phối hợp với nhau để vận hành như: thư ký, tiếp tân, hậu cần, truyền thông...
